棉花的產(chǎn)量及質(zhì)量受病害的限制是十分明顯的，特別是棉花黃萎病，是棉花生產(chǎn)上危害嚴(yán)重的病害。在世界各個種植棉花的地區(qū)都有發(fā)生。這種病害一直困擾著我國棉花的生產(chǎn)，黃萎菌變異迅速，往往導(dǎo)致抗病品種的抗性喪失，使得黃萎病大面積流行。

　　過去人們主要通過分離培養(yǎng)、生物學(xué)測定和鑒別寄主法等常規(guī)方法對黃萎病菌進(jìn)行研究，常規(guī)方法操作復(fù)雜、費(fèi)時、特異性不高。進(jìn)入20世紀(jì)80年代，隨著分子生物學(xué)，生物化學(xué)、免疫學(xué)等領(lǐng)域取得的巨大進(jìn)步，尤其血清學(xué)、核酸技術(shù)的應(yīng)用，為植物病原菌的快速檢測提供了許多新技術(shù)新方法，促進(jìn)了植物病害的檢測技術(shù)飛速發(fā)展，目前運(yùn)用于黃萎病菌鑒定上的技術(shù)主要有ELISA方法、RAPD分析、RFLP分析、AFLP分析、PCR鑒定等。植物病害檢測儀是近幾年對作物病害進(jìn)行有效檢測的儀器之一。

　　通過核酸技術(shù)可以實(shí)現(xiàn)對黃萎菌類型快速的鑒定，并且受外界因素影響比較小。具有快速、準(zhǔn)確、科學(xué)的特點(diǎn)。但也有它的局限性，如費(fèi)用較高，限制了它的普及應(yīng)用;目前其只能分出黃萎菌的表現(xiàn)型，不能夠確定菌株致病力的強(qiáng)弱等。在所有的鑒定方法中，鑒別寄主鑒定法是基本、有效的方法，其他方法由于只能區(qū)分類群間，如將黑白輪枝菌和大麗輪枝菌區(qū)分開或是將落葉型和非落葉型區(qū)分開，而在分析類群內(nèi)的差異時則不顯著，所以只能作為輔助手段，終需要用鑒別寄主鑒定法去驗(yàn)證。植物病害檢測儀在棉花黃萎病的檢測作用十分明顯。

　　總之，不同地區(qū)棉花黃萎病菌由于各自獨(dú)特的地理氣候條件，不同采集地的菌株可能存在一定的“地方性”特點(diǎn)。因此，在研究的過程中，將核酸技術(shù)與鑒別寄主法共同使用，可以提高鑒定結(jié)果的準(zhǔn)確性，使鑒定結(jié)果更加準(zhǔn)確完善。